在职博士与统招博士在入学方式、学习模式及证书获取等方面存在显著差异。在职博士免试入学、学习灵活，适合在职人员；统招博士需考试入学，全日制学习，适合专注科研者。证书方面，在职博士有单证与双证之分，而统招博士通常为双证，更具社会认可度。两者各有优势，适合不同人群根据自身需求选择。